Quer dar um replace digo um update no campo cpf para botar pontinho.....
Eu não aconselho mas vai que precise. :-(
--fazendo o teste
update <<<NOME DA TABELA>>> set cpf=CONCAT(SUBSTR(cpf,1,3),'.',SUBSTR(cpf,4,3),'.',SUBSTR(cpf,7,3),'-',SUBSTR(cpf,10,2)) where cpf='numero do cpf para teste'
-- Trocando geral menos o teste né....
update <<<NOME DA TABELA>>> set cpf=CONCAT(SUBSTR(cpf,1,3),'.',SUBSTR(cpf,4,3),'.',SUBSTR(cpf,7,3),'-',SUBSTR(cpf,10,2)) where cpf!='numero do cpf para teste'
Só para lembra vai que você precise retira um carácter porque o fornecedor vacilou.
update `temporaria` set `cpf`=replace(cpf,'-','')
select * from temporaria